Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I3

KICSTOR complex protein C12orf66 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P1I3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6P1I3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6P1I3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6P1I3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P1I3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P1I3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6P1I3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6P1I3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P1I3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P1I3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6P1I3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms