Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr44Q6NVE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr44Q6NVE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr44Q6NVE8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr44Q6NVE8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr44Q6NVE8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr44Q6NVE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Wdr44Q6NVE8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms