Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx11Q6AXC6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx11Q6AXC6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms