Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd180Q62192 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd180Q62192 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms