Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mre11Q61216 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mre11Q61216 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mre11Q61216 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms