Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cln3Q61124 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cln3Q61124 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cln3Q61124 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.2 ms