Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NinQ61043 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NinQ61043 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NinQ61043 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NinQ61043 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NinQ61043 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NinQ61043 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NinQ61043 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NinQ61043 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NinQ61043 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NinQ61043 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NinQ61043 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NinQ61043 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NinQ61043 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NinQ61043 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NinQ61043 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NinQ61043 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinQ61043 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinQ61043 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinQ61043 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NinQ61043 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NinQ61043 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NinQ61043 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NinQ61043 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinQ61043 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NinQ61043 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NinQ61043 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinQ61043 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NinQ61043 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NinQ61043 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinQ61043 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinQ61043 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinQ61043 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinQ61043 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinQ61043 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinQ61043 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NinQ61043 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinQ61043 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinQ61043 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NinQ61043 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinQ61043 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NinQ61043 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NinQ61043 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NinQ61043 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinQ61043 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinQ61043 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinQ61043 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinQ61043 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinQ61043 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NinQ61043 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinQ61043 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinQ61043 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinQ61043 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinQ61043 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinQ61043 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms