Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Traf3Q60803 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Traf3Q60803 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Traf3Q60803 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms