Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myh1Q5SX40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myh1Q5SX40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Myh1Q5SX40 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Myh1Q5SX40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myh1Q5SX40 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh1Q5SX40 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh1Q5SX40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms