Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbs12Q5SUD9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bbs12Q5SUD9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms