Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psme4Q5SSW2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psme4Q5SSW2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Psme4Q5SSW2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms