Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mdc1Q5PSV9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Mdc1Q5PSV9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mdc1Q5PSV9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms