Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc1Q5NCF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Trappc1Q5NCF2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc1Q5NCF2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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