Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo39Q5NBU5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo39Q5NBU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo39Q5NBU5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms