Protein–RNA interactions for Protein: Q4PLS0

Nlrp2, NACHT, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp2Q4PLS0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp2Q4PLS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp2Q4PLS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms