Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc3lQ4KL14 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc3lQ4KL14 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc3lQ4KL14 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms