Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228bQ497Q6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam228bQ497Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms