Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Carmil2Q3V3V9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Carmil2Q3V3V9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms