Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg1lQ3V384 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg1lQ3V384 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg1lQ3V384 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg1lQ3V384 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg1lQ3V384 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg1lQ3V384 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Afg1lQ3V384 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms