Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1N9

A3galt2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3galt2Q3V1N9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A3galt2Q3V1N9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A3galt2Q3V1N9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms