Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C87499Q3UX49 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms