Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skap1Q3UUV5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skap1Q3UUV5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skap1Q3UUV5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms