Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BB287469Q3UT53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BB287469Q3UT53 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms