Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SfswapQ3USH5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SfswapQ3USH5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms