Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms