Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx6-3Q3UHX8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx6-3Q3UHX8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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