Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tespa1Q3U132 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tespa1Q3U132 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tespa1Q3U132 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms