Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TchpQ3TVW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms