Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdlim7Q3TJD7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdlim7Q3TJD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdlim7Q3TJD7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdlim7Q3TJD7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms