Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2f1Q3THK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2f1Q3THK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms