Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
StumQ0VBF8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
StumQ0VBF8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms