Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntnap5aQ0V8T9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntnap5aQ0V8T9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntnap5aQ0V8T9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms