Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MestQ07646 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MestQ07646 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MestQ07646 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MestQ07646 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MestQ07646 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MestQ07646 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MestQ07646 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MestQ07646 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MestQ07646 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MestQ07646 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MestQ07646 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MestQ07646 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MestQ07646 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MestQ07646 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MestQ07646 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MestQ07646 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MestQ07646 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MestQ07646 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MestQ07646 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MestQ07646 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MestQ07646 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MestQ07646 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MestQ07646 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms