Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf9Q07105 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf9Q07105 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms