Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Siah2Q06986 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Siah2Q06986 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms