Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrx2Q06348 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prrx2Q06348 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms