Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Caprin2Q05A80 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Caprin2Q05A80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Caprin2Q05A80 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms