Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sox12Q04890 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sox12Q04890 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox12Q04890 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms