Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkczQ02956 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkczQ02956 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkczQ02956 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkczQ02956 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms