Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ascl1Q02067 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ascl1Q02067 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ascl1Q02067 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms