Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bmp1P98063 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmp1P98063 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp1P98063 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp1P98063 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp1P98063 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp1P98063 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bmp1P98063 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp1P98063 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms