Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbbp6P97868 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rbbp6P97868 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp6P97868 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms