Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tarbp2P97473 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tarbp2P97473 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms