Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RptnP97347 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RptnP97347 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RptnP97347 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RptnP97347 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RptnP97347 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RptnP97347 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RptnP97347 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RptnP97347 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RptnP97347 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RptnP97347 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RptnP97347 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RptnP97347 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RptnP97347 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RptnP97347 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RptnP97347 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RptnP97347 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RptnP97347 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RptnP97347 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RptnP97347 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RptnP97347 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RptnP97347 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RptnP97347 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RptnP97347 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RptnP97347 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RptnP97347 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RptnP97347 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RptnP97347 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RptnP97347 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RptnP97347 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RptnP97347 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RptnP97347 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RptnP97347 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms