Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdh9P70407 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh9P70407 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh9P70407 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh9P70407 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh9P70407 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh9P70407 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms