Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cux2P70298 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cux2P70298 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cux2P70298 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cux2P70298 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux2P70298 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Cux2P70298 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cux2P70298 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux2P70298 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux2P70298 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cux2P70298 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cux2P70298 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms