Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd13P70217 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hoxd13P70217 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd13P70217 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms