Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UbdP63072 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UbdP63072 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UbdP63072 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbdP63072 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UbdP63072 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbdP63072 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbdP63072 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbdP63072 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbdP63072 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbdP63072 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbdP63072 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbdP63072 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbdP63072 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbdP63072 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbdP63072 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbdP63072 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UbdP63072 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbdP63072 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbdP63072 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbdP63072 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbdP63072 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbdP63072 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbdP63072 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.2 ms