Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk5r1P61809 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5r1P61809 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms