Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smg6P61406 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smg6P61406 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smg6P61406 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smg6P61406 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smg6P61406 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smg6P61406 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smg6P61406 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smg6P61406 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smg6P61406 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Smg6P61406 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smg6P61406 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms